Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms