Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms