Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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