Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms