Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms