Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms