Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms