Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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