Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms