Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRRC1Q96M27 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms