Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms