Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms