Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms