Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms