Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms