Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG4Q92954 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms