Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP3Q8WYN3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP3Q8WYN3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms