Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN1Q8WXD9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms