Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms