Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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