Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHTF2Q8N3S3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms