Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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