Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms