Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H3Q8IVL6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H3Q8IVL6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H3Q8IVL6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H3Q8IVL6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H3Q8IVL6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H3Q8IVL6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms