Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SNX20Q7Z614 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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