Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms