Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms