Protein–RNA interactions for Protein: Q64LD2

WDR25, WD repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR25Q64LD2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
WDR25Q64LD2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms