Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRC38Q5VT99 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRC38Q5VT99 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRC38Q5VT99 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRC38Q5VT99 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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