Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms