Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms