Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms