Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms