Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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