Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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