Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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