Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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