Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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