Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms