Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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