Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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