Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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HDAC1Q13547 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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