Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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