Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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