Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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ITGB3BPQ13352 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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ITGB3BPQ13352 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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