Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms