Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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