Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRIM32Q13049 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRIM32Q13049 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRIM32Q13049 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRIM32Q13049 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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