Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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