Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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